Церковь Ильи Пророка вполне заслужено можно отнести к жемчужинам церковной архитектуры и живописи. Фрески, выполненные ярославскими мастерами в 17 веке, сохранились до наших дней в первозданном виде.
Церковь, названная в честь библейского ветхозаветного пророка Ильи, была заложена в 1647 году на средства богатых купцов Скрипиных. В городских летописях много говорится о богатстве этой семьи, и о том, что они были близки к русскому царю Алексею Михайловичу.
Церковь Ильи Пророка была окончательно достроена в 1650 году. Она располагалась на территории усадьбы Скрипиных и являлась частью ее архитектурного ансамбля. К завершению строительства патриарх Иосиф, с согласия царя Алексея Михайловича, передал в церковь частицу ризы Христа. Считается, что это часть хитона, в котором Иисус Христос был распят и потом он достался по жребию одному из воинов.
Долгое время Риза Христа хранилась в Грузии, но после того, как Грузия была покорена Персией в 1613 году. Шах Аббас I в знак дружбы передал ее в 1625 году в дар новому русскому царю Михаилу Романову. Сама риза хранится в Успенском соборе Московского Кремля и первые годы ее пребывания в России была традиция передавать ее частицы в другие церкви. Потом эту традицию прекратили.
Получив такую святыню, братья Скрипины решили богато украсить храм Ильи Пророка, хотя основные работы по отделке велись уже после их смерти. Все основные работы по отделке храма в 1670-1680-х годах вели артели местных мастеров. Иконописцы расписывали стены и своды храма Ильи Пророка, а также иконы на иконостасе. Резчики по дереву, изразечники и серебренники создавали оклады икон на иконостасе. В отделке храма Ильи Пророка принимали участие и мастера других профессий.
В итоге, к началу 18 века Церковь Ильи Пророка была одним из лучших образцов мастерства художественной школы церковного искусства. Все росписи, как внутреннего теплого предела, так и внешних приделов и галерей, дошли до наших дней в идеальной сохранности.
В настоящий момент церковь Ильи Пророка функционирует как музей, а службы здесь проводятся только по большим церковным праздникам. Частица Ризы Христа была передана в Толгский женский монастырь. В непосредственной близости от Церкви Ильи Пророка находятся Спасо-Преображенский монастырь, а также Успенский собор.