Монастырь Самтавро находится в древнем городе Мцхета на том месте, где был сад царя Мириана. В переводе Самтавро означает «Царская территория». Здесь происходило крещение царя в 326 году, а он уже провозгласил христианство государственной религией Иберии.
Первая небольшая церковь Святой Нины на территории монастыря Самтавро была построена самим царем Мирианом. Она называется Святая Святых, и даже царь не прикасался к ее дверям. В будущем эта церковь перестраивалась, но в целом она сохранила черты того храма 4 века. С 11 века Самтавро был мужским монастырем, но в 1820 году он стал женским.
Святая Нина была похоронена в 347 году в монастыре Бодбе на территории Кахетии. Вернувшись с ее похорон, царь Мириан начал строительство большого Преображенского собора в монастыре Самтавро, который стал усыпальницей для него. До наших дней сохранился Преображенский собор 11 века. Он была построен в одно и то же время с Храмом Светицховели. Собор сильно пострадал во время нашествия Тамерлана, а также из-за землетрясения 1283 года, но в 13 веке его прежний облик был восстановлен.
В более поздние века в монастыре были построены храмы Архангела Михаила и Иоанна Крестителя. Колокольня и стена монастыря возведены в 19 веке. Кроме царя Мариана и его жены Наны в монастыре похоронены многие почитаемые в Грузии святые.
Здесь же похоронен и известный во всей Грузии Святой Гавриил. Он стал настоятелем монастыря Самтавро в 1971 году. К нему приходили за помощью многие люди. При жизни его называли старцем, который наставлял своих духовных детей. Умер Гавриил в 1995 году, а в 2012 году он был канонизирован. Сейчас его мощи хранятся в Преображенском Соборе.