Экспонаты Музея Деревянного зодчества Коломенское находятся в разных частях усадьбы Коломенское. Здесь собрано много деревянных построек, имеющих реальную историческую ценность: домик Петра I из Архангельска, башни острога из Братска, церкви и башни острогов с Белого моря и Карелии. Также здесь восстановлен деревянный дворец Алексея Михайловича, который был в Коломенском в 17 веке.
Большая часть деревянных построек сосредоточена в северной части парка, ближе к станции метро Коломенское. Дом Петра I расположен в центральной части парка недалеко от Церкви Казанской Иконы Божьей Матери. Деревянный дворец Алексея Михайловича, восстановлен по рисункам и гравюрам 17 века, но он расположен достаточно далеко (в 2 километрах) от своего исторического места на южной стороне парка, около станции метро Каширская.
В северной части парка расположено несколько интересных объектов: Башня Братского острога (1654 г), Башня Николо-Карельского монастыря (17 в), Моховая башня Сумского острога (1680 г), Церковь Святого Георгия Победоносца (1685 г). На Моховой башне Сумского острога видны следы шведской картечи, которые атаковали Архангельск во время Северной войны.
Башня Братского острога была привезена в Коломенское в 1959 году, когда при строительстве Братской ГЭС деревянная крепость 17 века попала в зону затопления. Недалеко от набережной находится копия дома, в котором царь Петр жил в голландском городе Заандам, когда учился там корабельному делу.
Самый ценный экспонат Музея Деревянного зодчества в Коломенское – это дом Петра I. Он был построен 1702 году, когда шли активные боевые действия в Северной войне со Швецией, которую Россия вела за выход к Балтийскому морю. Живя в этом доме, царь Петр руководил строительством Новодвинской крепости для защиты Архангельска от шведов.
Деревянный дворец Алексея Михайловича, который в 16 веке располагался около Церкви Казанской Божьей Матери, современники называли восьмым чудом света. Конечно, сравнение с чудесами света античного мира не корректно, но этот дворец действительно был большим и красивым. К концу 18 века, когда столица была перенесена в Санкт-Петербург, содержанием этого дворца заниматься было некому. Он сильно обветшал и был разобран. Однако, в 2010 году он был воссоздан по историческим чертежам и рисункам.