Музей Пио-Клементино расположен в залах Бельведерского дворца. Он был создан в 1769 году папой Климентом XIV, и достроен папой Пием VI. Так музей и назвали в честь этих пап. В нем храниться наиболее ценные греческие и римские скульптуры.
Вначале скульптур было не очень много, и они были расположены в нишах Внутреннего дворика были установлены наиболее ценные скульптуры:
Ниша Лаокоона. В ней установлена мраморная группа «Лаокоон и сыновья», сделанная в начале I века н. э. родосскими мастерами. В 1506 г. фрагменты группы были найдены в Риме на территории Золотого дома Нерона и отреставрированы Микеланджело.
Ниша Кановы. В ней установлена копия скульптуры Персея. Оригинал был разрушен солдатами Наполеона, и его копию в 1800 году сделал скульптор Антонио Канова, по заказу папы Пия VІ.
Ниша Аполлона. В ней установлена, пожалуй, самая известная скульптура Ватиканского музея – Аполлон Бельведерский. Это мраморная римская копия 130 года с бронзового оригинала афинского скульптора Леохара 4 века до н.э. В Ватиканском музее она хранится с 1509 года.
Ниша Гермеса. С ней установлена римская копия древнегреческой скульптуры Гермеса, которая была создана Праксителем в 4 веке до н э. и стояла в Священной Олимпии. Римская копия была найдена около Замка Ангела.
Кроме этих четырех ниш в Музее Пио-Клементино еще есть Зал Животных, где собраны античные скульптуры животных, а также Галерея статуй. В ней собраны античные статуи. Зал Ротонда был построен в 1780 году. В центре установлена гигантская чаша из порфира (13 м) из Золотого Дворца Нерона. Вокруг нее в нишах установлено 18 статуй римских и греческих богов. В Зале Греческого Креста можно посмотреть порфировые саркофаги, римские мозаики.