В 4 километрах на север от Соловецкого Кремля находится Макарьевская пустынь. Она закрыта с трех сторон высокими холмами, а с юга сюда поступает теплый воздух. Это сформировало здесь особый климат, позволивший монахам выращивать арбузы и другие, нетипичные для русского севера, растения.
В 1819 году в Соловецкий монастырь прибыл архимандрит Макарий из Валаамского монастыря. Он жил там уединенно, в Пустыни, и здесь также решил не селиться в Соловецком Кремле, а выбрал себе уединенное место, которое так и стали называть Макарьевская Пустынь.
Обеспечение лекарственными травами и плодами было очень важно для монастыря, поэтому особые климатические условия Макарьевской пустыни были сразу оценены и здесь стал создаваться Соловецкий Ботанический Сад. На протяжении всего 19 века из монастыря отправлялись экспедиции в разные регионы России, во время которых монахи привозили лечебные растения, не типичные для северного климата Беломорья, но которые можно было культивировать в Ботаническом саду Макарьевской пустыни.
В 1860 году на вершине холма был построен большой двухэтажный дом, который назвали Дача Архимандрита. В летний период в ней жил настоятель монастыря. А несколькими годами раньше, в 1854 году, здесь же в Макарьевской пустыни была построена часовня в честь Святого Александра Невского. Она была поставлена в память обороны Соловецкого монастыря во время нападения английских кораблей во время Крымской войны.
И сейчас в часовне можно прочитать надпись об этих событиях: «Настоятель архимандрит Александр поставил на сей гopе в 1854 г. Крест Господень и часовню во имя Святаго Великого князя Александра Невскаго, ангела своего, и гopa сия названа «Александровская» за спасение жизни своей при нападении Англичан на Соловецкую обитель в 1854 г. июля 6 и 7 числа, в самую страшную канонаду, под градом ядер и бомб 36 и 96 фун. летавших над головами во время крестнаго хода вокруг монастыря».
Кроме растений и кустов в Макарьевской пустыни можно полюбоваться красивыми деревьями, большой кедровой рощей, а также лиственничной аллеей, которая, кстати, была посажена в 1933 году в период Соловецкого лагеря НКВД. Коммунисты разрушили на Соловках много монастырский строений, но Ботанический Сад не тронули, более того, всячески за ним ухаживали и расширяли.
Чуть севернее Макарьевской пустыни на острове Соловецкий расположено еще три скита: Свято-Вознесенский скит на Секирной горе, Савватиевский скит и Исаакиевский скит. Наибольший интерес из них представляет Секирная гора.