В 16 веке Тобольск был столицей Сибири. В 1582 году произошла битва на Чувашском мысу, во время которой отряд Ермака Тимофеевича разбил войско татарского хана Кучума и окончательно присоединил к России сибирские земли.
Спустя 5 лет, в 1587 году, на Алафеевской горе, в 17 километрах от места битвы на Чувашском мысу, казаки построили деревянный острог с церковью Святой Троицы. Этот год стал датой основания города Тобольска. Тобольский острог стал вторым в Сибири. На год раньше был заложен острог Тюмени, но он выполнял лишь транзитные функции, а столицей Сибири, на два столетия суждено было стать именно Тобольску.
В 1596 году Тобольск был утвержден в статусе Столицы Сибирского приказа, а в 1621 году он стали и Духовным центром Сибирской епархии. Несмотря на частые пожары, Тобольск быстро развивался, и в 1683 году в Тобольском Кремле началось возведение первого каменного здания в Сибири – Софийского собора. В этом же году мастера начали строить еще один каменный храм (второй в Сибири) - Знаменский собор в Абалакском монастыре, в 20 километрах от Тобольска.
В 1782 году императрица Екатерина II учреждает в Тобольске наместничество с подчинением ему городов Сибири. Первым губернским архитектором А. Гучевым, приехавшим из Санкт-Петербурга, разрабатывается новый генеральный план города и проект перестройки Кремля. В нем появляются два новых здания: дворец Наместника и Архиерейский дом. Екатерина II присылает во Дворец Наместника царский трон. Таких тронов всего три в России – в Санкт-Петербурге, в Москве и в Тобольске. Этим подчеркивалась исключительная важность и высокий статус Тобольска, как столицы огромных земель к востоку от Урала.
Однако наместничество в Тобольске просуществовало всего несколько лет, и уже следующий император Павел I в 1797 году отменил институт наместничества и вернул губернское административное деление. В 19 веке значимость Тобольска и его статус значительно снизился. В 1804 году была отделена Томская губерния, в которую вошли все земли западнее Томска, а в 1838 году столица Западной Сибири была перенесена из Тобольска в Омск.
Причина заката первых сибирских городов заключалась в переносе торговых дорог на юг. Изменился характер освоения Сибири, экономическая активность, а за ней и население сдвинулись в южные регионы лесостепные регионы Сибири. Там же, в конце концов, прошла и Транссибирская магистраль. Так что в 20 веке Тобольск стал небольшим районным городом.
Однако, несмотря на потерю административного статуса, Тобольск смело можно назвать самым интересным городом Сибири для туристической поездки, так как здесь остались замечательные памятники 17-18 веков, которые были построены в период его расцвета.